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原發(fā)性免疫缺陷病的新方法

閱讀:487發(fā)布時間:2015-1-6


在臨床實踐中,原發(fā)性免疫缺陷病(PID)的準確診斷通常很困難,因為臨床癥狀多樣且當前的診斷過程復雜。

原發(fā)性免疫缺陷病是一組由免疫系統(tǒng)的遺傳缺陷而引起的疾病,大約有200多種,其特點是嚴重、反復出現(xiàn)且危及生命的感染。目前的檢測方法包括細胞毒性分析和流式細胞術(shù)。

遺傳檢測能協(xié)助醫(yī)生確定治療策略。然而,與PID相關(guān)的基因有200多個,往往不太清楚應當檢測哪些基因。不同基因中的突變可能導致類似的表型,而相同基因中不同部分的突變卻可能出現(xiàn)不同的表型。重要的是,實驗室認證的檢測有時只覆蓋一小部分致病基因,因此檢測需要被分到不同的實驗室。

研究人員利用QIAGENFlexiGene DNA Kit從全血中提取DNA。對于某些患者,血液也利用PreAnalytixPaxgene Blood RNA*來采集。然后他們利用Paxgene Blood RNA Kit來提取RNA,其中500 ng用于羅氏First-strand cDNA synthesis for RT-PCRcDNA合成。研究人員設(shè)計出靶向富集分析,覆蓋與PID相關(guān)的179個基因的所有外顯子。隨后由GATC BiotechIlluminaGAIIx系統(tǒng)上開展高通量測序。

研究人員能夠?qū)⒁恍┎∫虿幻鞯牟±c已知的基因突變相匹配。兩名個體帶有STAT3基因的突變,兩名帶有lambda 5(IGLL1)基因的突變,還有一名帶有RNF168基因中的兩個不同突變。

根據(jù)這項研究的結(jié)果,作者建議PID的診斷分兩個階段:首先使用相對便宜且快速的靶向分析,它能解釋大多數(shù)疾病,之后對此分析不能分辨的病例進行全外顯子組或全基因組測序。

分析技術(shù)讓診斷PID的多重檢測更加有用。利用第二代HaloPlex設(shè)計,99.5%的目標區(qū)域被覆蓋,而現(xiàn)有分析為98.6%。再加上更好的序列覆蓋度和讀取深度,這將大大改進分析的性能,



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