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LncRNA控制造血干細胞功能

閱讀：284發(fā)布時間：2015-3-20


研究小組確定了富集在小鼠造血干細胞（HSCs）中的159個未注釋lncRNA（LncHSCs），其中兩個lncRNA的敲除可影響HSC的自我更新和分化。

造血干細胞（HSCs）具有*的基因表達程序，可執(zhí)行干細胞的身份確定和調(diào)節(jié)細胞譜系定型。長非編碼RNA（lncRNAs）已經(jīng)成為基因表達和細胞命運決定的重要調(diào)節(jié)因子，然而它們在造血干細胞中的功能尚不清楚。

在這項研究中，研究人員通過深度測序描述了純化造血干細胞的轉(zhuǎn)錄組，并鑒定了323個未加注釋的lncRNAs。通過在已分化的細胞譜系中比較它們的表達，發(fā)現(xiàn)有159個lncRNAs富集在造血干細胞中，其中一些可能是HSC特異性的（lnchscs）。這些lncRNA基因與蛋白編碼基因具有相同的表觀遺傳特征，包括通過DNA甲基化調(diào)控表達，敲除掉兩個lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2，對HSC自我更新和譜系決定具有不同的影響。

該研究小組找出了其中一個候選lncRNA的基因組結合位點，并發(fā)現(xiàn)了關鍵造血轉(zhuǎn)錄因子結合位點的富集，特別是E2A?？偠灾?，這些結果表明，lncRNAs對調(diào)節(jié)造血干細胞起著重要的作用，從而為控制HSC功能的遺傳通路提供了更多的層面。


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