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Arraystar lncRNA芯片應用于動脈粥樣硬化研究

閱讀:143發(fā)布時間:2016-6-3

 

動脈粥樣硬化是一種脂質代謝與炎癥性血管病變,是引起心腦血管時間的常見疾病。來自廣州南方醫(yī)院的研究者發(fā)現(xiàn)動脈粥樣硬化新的分子機制,解釋了斑塊形成過程中非編碼RNA RP5-833A20.1如何通過microRNA和轉錄因子調控了炎癥因子以及細胞內的脂肪運輸過程,有可能對疾病治療產生重要影響。

研究背景

動脈粥樣硬化斑塊的形成與血管內皮細胞,血管平滑肌細胞以及巨噬細胞有關。巨噬細胞吞噬大量氧化型低密度脂蛋白*,導致細胞內脂質堆積,形成泡沫細胞從而促發(fā)了動脈粥樣硬化的炎癥反應;構成脂質核心和動脈粥樣硬化病變。lncRNA的研究得到了世界范圍的關注。此前雖然有發(fā)現(xiàn)心血管相關lncRNA的報道,然而數(shù)目有限,該領域還有廣闊的研究空間。

研究思路

該研究利用THP-1巨噬細胞和THP-1來源的泡沫細胞進行比較,找到100個差異表達的lncRNA,63mRNA分子(差異倍數(shù)大于3p值小于0.01)。通路網(wǎng)絡分析表明差異表達的基因參與動脈粥樣硬化,G蛋白耦聯(lián)受體等重要通路。從差異表達的分子中選擇與疾病相關的轉錄因子NFIA以及位于其內含子中的lncRNA RP5-833A20.1進行深入研究。

過表達和干擾實驗證明lncRNA RP5-833A20.1NFIA具有負調控作用。分子機制實驗中發(fā)現(xiàn)mir-382-5p可結合NFIA3 UTR區(qū)域抑制NFIA 表達,而RP5-833A20.1參與了mir-382-5p的成熟加工過程。體外細胞實驗證明RP5-833A20.1/mir-382-5p/NFIA通路調控了炎癥細胞因子的表達以及細胞內的脂肪聚集;小鼠活體實驗發(fā)現(xiàn)NFIA過表達顯著抑制斑塊的形成,降低循環(huán)系統(tǒng)中的炎癥因子濃度,促進*代謝的作用,是可能的動脈粥樣硬化治療靶點。

研究意義該研究從疾病細胞模型出發(fā),通過芯片篩選以及基因組注釋信息找到重要的lncRNA分子和它的靶標,以microRNA為媒介串聯(lián)成一條完整的通路。體外及體內實驗設計系統(tǒng)和完整,找到了關鍵的治療靶點。為的心血管疾病lncRNA研究開拓了研究思路。


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