中科院上海生科院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所景乃禾研究組與中科院—馬普學(xué)會計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所韓敬東研究組合作，研究結(jié)合激光顯微切割以及單細(xì)胞測序等技術(shù)，繪制了小鼠早期發(fā)育原腸運(yùn)動中期精細(xì)的胚胎三維分子圖譜，并揭示了小鼠細(xì)胞譜系藍(lán)圖建立過程中的空間轉(zhuǎn)錄組特征、轉(zhuǎn)錄因子和信號通路調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。相關(guān)研究成果3月22日在線發(fā)表于《發(fā)育細(xì)胞》。
科研人員建立了基于激光顯微切割和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的空間轉(zhuǎn)錄組分析方法，完成了小鼠原腸運(yùn)動中期（E7.0）單個胚胎組織切片位置特異的轉(zhuǎn)錄組測序。他們發(fā)現(xiàn)并鑒定了許多新的胚層特異標(biāo)記基因，構(gòu)建了全胚胎基因表達(dá)三維分子圖譜，使得小鼠這一時期兩萬多個基因的表達(dá)能夠以電子原位雜交的形式得到*呈現(xiàn)。同時，該工作還鑒定了一組能夠代表E7.0時期發(fā)育狀態(tài)和特異空間結(jié)構(gòu)域的標(biāo)志基因，可將外源的多能干細(xì)胞或胚胎組織細(xì)胞“投遞”到體內(nèi)胚胎的特定位置，從而將未知來源的干細(xì)胞定位于體內(nèi)胚胎的相應(yīng)部位。
專家認(rèn)為，該研究為認(rèn)識干細(xì)胞的性與分化潛能以及干細(xì)胞轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供了全新的視角和理論指導(dǎo)。
據(jù)悉，該項(xiàng)研究工作是與發(fā)育生物學(xué)家、英國*科學(xué)院院士、澳大利亞悉尼大學(xué)教授Patrick Tam合作完成的。