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研究人員解析ttsRNA在細(xì)菌轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中的作用

閱讀:1125發(fā)布時間:2012-7-6

    研究者在肺炎支原體(大鼠肺炎支原體)中發(fā)現(xiàn)了一類在基因組中廣泛存在的小RNA,它們位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周圍,因此稱為tssRNAs。這種小RNA在大腸桿菌中也檢測得到。

    與zui近在真核生物中鑒定出來的與啟動子結(jié)合的tiRNA相似,tssRNAs也與激活的啟動子結(jié)合。實(shí)驗表明,這些小RNA與轉(zhuǎn)錄流產(chǎn)的RNA不同,這些單鏈RNA平均長度為45個堿基。在基因組中,幾乎每個ttsRNA都有其對應(yīng)的全長轉(zhuǎn)錄本,ttsRNA序列與這些轉(zhuǎn)錄本的開頭序列以及它們對應(yīng)的起始位點(diǎn)匹配。體外表達(dá)細(xì)菌的tssRNA除了RNA聚合酶全酶之外還需要其它的因子。此外,實(shí)驗表明RNA聚合酶在tssRNA位點(diǎn)處會停駐。

    研究者認(rèn)為,這可能是細(xì)菌在轉(zhuǎn)錄過程中對轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)的一個檢驗點(diǎn),比如檢查RNA聚合酶的裝配是否正確、轉(zhuǎn)錄起始因子有沒有丟掉、延伸因子有沒有到位等。ttsRNA的存在提示了一種轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制,同時也表明,通過能結(jié)合轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的小RNA對基因轉(zhuǎn)錄進(jìn)行調(diào)控的方式在細(xì)菌中可能普遍存在。

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