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癌癥通路新研究:“睡美人”基因

時間:2011-11-8閱讀:292
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生物通報道:來自英國李嘉誠中心(Li Ka Shing Centre),劍橋癌癥研究所,桑格學院等處的研究人員發(fā)表了題為“Insertional mutagenesis reveals multiple networks of co-operating genes driving intestinal tumorigenesis”的文章,發(fā)現(xiàn)了一種稱為“睡美人”的跳躍基因在分析癌癥通路中的重要作用,這一研究成果公布在Nature Genetics雜志上。生物通
這項研究由英國劍橋癌癥研究所的Douglas J Winton,以及桑格學院的David Adams領(lǐng)導完成,Adams博士表示,“將這些發(fā)現(xiàn)與人類結(jié)腸癌突變數(shù)據(jù)結(jié)合起來,就能加深對大腸癌發(fā)生發(fā)展過程的了解”,“這項研究證明了這種癌癥發(fā)生過程涉及了多少基因,以及這項基因在癌癥發(fā)展過程中的作用”。
大腸癌(colorectal cancer)是常見的消化道惡性腫瘤之一,這種疾病死亡率較高,近年來由于高脂肪、高蛋白和低纖維飲食易引起了越來越多大腸癌。今年*就因大腸癌赴臺北榮民總醫(yī)院進行手術(shù)。
研究顯示在每種癌細胞中都存在大約5到20種主要的突變,但是到底有多少種,以及如何識別這些突變,目前科學家們還不清楚。在這篇文章中,研究人員通過在小鼠中篩選癌基因,并與人類癌癥數(shù)據(jù)進行比對,識別了大量新候選基因,這些基因?qū)⒂兄诙x幫助腸癌發(fā)展的遺傳途徑。生物通
研究人員采用了一種稱為“睡美人”轉(zhuǎn)座系統(tǒng)的方法來幫助分析找到癌基因,這種方法將可能幫助人們更加地確定基因的身份。“睡美人”(Sleeping Beauty)基因利用了跳躍DNA的一個片段——跳躍基因(轉(zhuǎn)座子)能夠?qū)⒆约翰迦牖蚧蚧蛑g,并因此能夠活化或者失活一個基因的正常功能。利用這一方法,研究人員發(fā)現(xiàn)了200多個人類大腸癌中基因變異,為診斷,治療和預后提供了多個候選基因靶標,也定義了腸癌癌基因的范圍。
其實采用“睡美人”轉(zhuǎn)座系統(tǒng)分析癌基因并不少見,在1997年,明尼蘇達州大學的研究人員從魚中獲得了一些非功能性的跳躍基因,并讓它們恢復了跳躍能力,這再次激活了在千萬年進化過程中處于沉睡的跳躍基因,因此被命名為“睡美人”。之后不少研究人員都利用這一系統(tǒng),根據(jù)“睡美人”是否開啟或者關(guān)閉它們來確定出與癌癥有關(guān)的基因。生物通
(生物通:萬紋)
原文檢索:生物通
March HN et al. (2011) Insertional mutagenesis reveals multiple networks of co-operating genes driving intestinal tumorigenesis. Nature Genetics, published online on Sunday 6 November 2011
Insertional mutagenesis identifies multiple networks of cooperating genes driving intestinal tumorigenesis生物通

The evolution of colorectal cancer suggests the involvement of many genes. To identify new drivers of intestinal cancer, we performed insertional mutagenesis using the Sleeping Beauty transposon system in mice carrying germline or somatic Apc mutations. By analyzing common insertion sites (CISs) isolated from 446 tumors, we identified many hundreds of candidate cancer drivers. Comparison to human data sets suggested that 234 CIS-targeted genes are also dysregulated in human colorectal cancers. In addition, we found 183 CIS-containing genes that are candidate Wnt targets and showed that 20 CISs-containing genes are newly discovered modifiers of canonical Wnt signaling. We also identified mutations associated with a subset of tumors containing an expanded number of Paneth cells, a hallmark of deregulated Wnt signaling, and genes associated with more severe dysplasia included those encoding members of the FGF signaling cascade. Some 70 genes had co-occurrence of CIS pairs, clustering into 38 sub-networks that may regulate tumor development.

 

來源:生物通

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