生物通報道  來自紀(jì)念斯隆-凱特琳癌癥中心的研究人員，與德國的合作者們一起，開發(fā)出了一種在多細胞環(huán)境中鑒別胞內(nèi)蛋白及分泌蛋白來源細胞的新方法。該研究在線發(fā)布在6月30日的《自然方法》（Nature Methods）雜志上。多細胞環(huán)境的形成及維持有賴于廣泛的細胞間相互通訊。細胞相互作用調(diào)控失常在包括癌癥在內(nèi)的許多疾病中起重要作用。盡管抗體分析被廣泛應(yīng)用于細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究中，但這種方法相對低通量，特異性差異大，且需要預(yù)先選擇蛋白質(zhì)讀數(shù)。盡管以定量質(zhì)譜為基礎(chǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)克服了其中的一些限制，由于無法區(qū)分多細胞培養(yǎng)物中來自不同細胞類型的蛋白質(zhì)，用質(zhì)譜法進行細胞通訊研究受到阻礙。
研究人員開發(fā)了一種稱作為CTAP的細胞選擇性蛋白質(zhì)組學(xué)新技術(shù)，是基于脊椎細胞無法合成生長及維持穩(wěn)態(tài)通常所需的一些“必需”氨基酸這一事實。這些氨基酸可由某些植物、細菌和低等真核生物生成，被添加到培養(yǎng)脊椎動物細胞培養(yǎng)基中，動物需通過飲食來獲取它們。Gauthier、Miller和合作者們操控細胞表達一些氨基酸生物合成酶，這使得細胞能夠利用添加的氨基酸前體來生成必需氨基酸，滿足自身生長需要。
研究小組證實，通過添加重穩(wěn)定同位素標(biāo)記的氨基酸前體，可導(dǎo)致重同位素標(biāo)記氨基酸摻入到酶表達細胞生成的蛋白質(zhì)中。利用定量質(zhì)譜搜索包含這些穩(wěn)定同位素標(biāo)記的蛋白質(zhì)，研究人員能夠確定多細胞培養(yǎng)物中胞內(nèi)蛋白質(zhì)和分泌蛋白質(zhì)的來源細胞。這一技術(shù)突破為研究人員提供了一個綜合繪制細胞通訊圖譜的新工具，細胞之間相互通訊對于癌癥形成、維持及治療反應(yīng)各個方面均至關(guān)重要。例如，利用這一方法研究人員可以研究正常細胞和惡性細胞之間的細胞信號傳導(dǎo)事件，從而更好地了解周圍正常細胞改變腫瘤生長以及治療反應(yīng)的分子機制。
由于能將蛋白質(zhì)與特殊細胞類型直接關(guān)聯(lián)起來，研究人員認(rèn)為這一方法將能夠適用于研究細胞間的通訊及發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)記物。        來源：生物通