近日《自然—方法學(xué)》介紹了一種可制造包含了數(shù)千堿基對(duì)的無差錯(cuò)長(zhǎng)DNA序列的方法。該方法采用單分子實(shí)時(shí)（SMRT）測(cè)序技術(shù)并在無參照測(cè)序組的情況下簡(jiǎn)化了細(xì)菌基因組的組裝過程，以便更好地了解細(xì)菌基因組在生態(tài)學(xué)和病理學(xué)中充當(dāng)?shù)慕巧约案櫰溥M(jìn)化。  

細(xì)菌基因組通常是由通過第二代測(cè)序設(shè)備產(chǎn)生的短DNA序列片段拼合而成，但這樣產(chǎn)生的基因組存在著一些難以填滿的空隙。zui近研發(fā)出的一些混合法將不同測(cè)序技術(shù)結(jié)合并填充了短序列組裝后留下的空隙，比如那些由常規(guī)第二代測(cè)序設(shè)備產(chǎn)生的空隙和那些由SMRT測(cè)序技術(shù)產(chǎn)生的雖然度較差，但更長(zhǎng)一些的序列片段的信息所導(dǎo)致的空隙。這種方法需要復(fù)雜的測(cè)序庫(kù)和測(cè)序設(shè)備。  

許多測(cè)序應(yīng)用對(duì)長(zhǎng)序列一直都有著較高需求，但是錯(cuò)誤率限制了其效用。Jonas Korlach等人設(shè)計(jì)的方法利用同一序列庫(kù)中的較短序列片段修正了長(zhǎng)序列片段中的錯(cuò)誤，使得細(xì)菌基因組和人造細(xì)菌染色體的組裝在全自動(dòng)流水線中具有高質(zhì)量、無空隙的優(yōu)點(diǎn)。同時(shí)，該方法還有效解決了重復(fù)測(cè)序中的一些難題。
來源：科學(xué)網(wǎng)