近日《自然—方法學》介紹了一種可制造包含了數(shù)千堿基對的無差錯長DNA序列的方法。該方法采用單分子實時（SMRT）測序技術(shù)并在無參照測序組的情況下簡化了細菌基因組的組裝過程，以便更好地了解細菌基因組在生態(tài)學和病理學中充當?shù)慕巧约案櫰溥M化。  

細菌基因組通常是由通過第二代測序設備產(chǎn)生的短DNA序列片段拼合而成，但這樣產(chǎn)生的基因組存在著一些難以填滿的空隙。zui近研發(fā)出的一些混合法將不同測序技術(shù)結(jié)合并填充了短序列組裝后留下的空隙，比如那些由常規(guī)第二代測序設備產(chǎn)生的空隙和那些由SMRT測序技術(shù)產(chǎn)生的雖然度較差，但更長一些的序列片段的信息所導致的空隙。這種方法需要復雜的測序庫和測序設備。  

許多測序應用對長序列一直都有著較高需求，但是錯誤率限制了其效用。Jonas Korlach等人設計的方法利用同一序列庫中的較短序列片段修正了長序列片段中的錯誤，使得細菌基因組和人造細菌染色體的組裝在全自動流水線中具有高質(zhì)量、無空隙的優(yōu)點。同時，該方法還有效解決了重復測序中的一些難題。
來源：科學網(wǎng)