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來自中科院動物研究所的譚錚研究組研究人員建立了一種熒光方法來實時檢測分子內(nèi)四重折疊結(jié)構(gòu)解旋的動力學過程,并通過這一方法發(fā)現(xiàn)G四聯(lián)體結(jié)構(gòu)阻礙BLM解旋酶在DNA鏈上的滑動,這一研究成果公布在J. Am. Chem. Soc.雜志上。
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領(lǐng)導這一研究的是動物研究所譚錚研究員,這位研究人員回國后曾在華南理工大學,武漢大學等多處任職,2005年加入中科院動物研究所,曾獲得國家杰出青年科學基金,入選*"百人計劃"國外引進杰出人才,其課題組主要研究方向是衰老的分子生物學研究。
人和其它物種的基因組中廣泛存在著能形成G-四重折疊結(jié)構(gòu)的序列,G-四重折疊結(jié)構(gòu)在調(diào)控基因表達和維持基因組穩(wěn)定性等生物學過程中扮演著重要角色。四重折疊結(jié)構(gòu)如何在生理過程中影響DNA和RNA的功能,例如轉(zhuǎn)錄和翻譯,仍然是一個需要解決的重要問題。
在這篇文章中,研究人員建立了一種熒光方法來實時檢測分子內(nèi)四重折疊結(jié)構(gòu)解旋的動力學過程。通過這種方法,他們研究了BLM解旋酶解旋人端粒序列、ILPR和PSMA4序列形成的四重折疊結(jié)構(gòu)的過程,并與這些序列相應(yīng)的雙鏈的解旋進行了對比。他們發(fā)現(xiàn)四重折疊結(jié)構(gòu)的解旋比其雙鏈結(jié)構(gòu)的解旋要困難得多,并且四重折疊結(jié)構(gòu)的解旋效率跟其穩(wěn)定性是相關(guān)的。這些結(jié)果意味著四重折疊結(jié)構(gòu)的形成能夠產(chǎn)生一種障礙影響蛋白質(zhì)在核酸鏈上的滑動,從而有可能調(diào)節(jié)基因組DNA的打開和復性過程。
除此之外,譚錚研究組還在Anal. Chem.雜志上發(fā)文,利用一個新建立的測定Kf的等溫差異雜交方法,為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。
人端粒DNA和其他很多富*(G)序列能形成一類稱作*-四重折疊(G-quadruplex)的DNA四重折疊結(jié)構(gòu)。這種結(jié)構(gòu)與很多生物學過程、治療癌癥以及分子機器有關(guān)。折疊平衡常數(shù)Kf是衡量G-四重折疊形成能力的定量描述。生理條件下的G-四重折疊結(jié)構(gòu)不是獨立存在,而是伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或與蛋白結(jié)合。然而現(xiàn)有的Kf測定方法只能用于核心序列。
在這篇文章中,譚錚研究組建立了一個測定Kf的等溫差異雜交方法,不僅能用于核心序列,同時適用于伴有旁側(cè)結(jié)構(gòu)或結(jié)合蛋白存在的情況這一方法將為了解生理條件下G-四重折疊形成提供一個有用的工具。
來源:生物通
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