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繼2008年、2009年成功評選出“生命科學(xué)創(chuàng)新產(chǎn)品”之后,生物通于2010年11月第三度推出“生命科學(xué)創(chuàng)新產(chǎn)品”評選活動。在這次活動中,我們共收到50個候選產(chǎn)品。經(jīng)過三個月的讀者投票和專家評鑒,2010生命科學(xué)創(chuàng)新產(chǎn)品終于出爐……
*,5-甲基胞嘧啶(5-mC)是哺乳動物基因組DNA中主要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)志。除此之外,研究人員zui近還發(fā)現(xiàn)了一種新的表觀遺傳學(xué)修飾——5-羥甲基胞嘧啶(5-hmC)。它在表觀遺傳學(xué)上的功能可能與5-mC不同。盡管到現(xiàn)在為止還不確知其功能,有研究人員猜測它在調(diào)控基因的表達(dá)與關(guān)閉過程中起著重要的作用。現(xiàn)有技術(shù)能夠鑒定出基因組DNA中的5-mC,但是卻無法區(qū)分5-mC和5-hmC。
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此,New England Biolabs(以下簡稱NEB)推出了EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒。此試劑盒是市場上*個定量5-hmC的PCR型分析,且操作簡便,只需三步。它利用T4 β-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(T4-BGT)在5-hmC的羥基上添加葡萄糖,從而區(qū)分5-mC和5-hmC。當(dāng)5-hmC出現(xiàn)在CCGG的背景下,這種修飾將一個可切割的MspI位點轉(zhuǎn)化成不可切割的。此外,這種方法還能與現(xiàn)有的分析技術(shù)兼容,從而擴(kuò)展到高通量。
這種創(chuàng)新的工具簡化了表觀遺傳學(xué)研究,能幫助我們了解5-hmC在表觀基因組中的作用,對疾病相關(guān)生物標(biāo)志物的開發(fā)很關(guān)鍵。因此,它也被評為“2010生命科學(xué)創(chuàng)新產(chǎn)品”。為此,生物通就一些讀者感興趣的問題,采訪了NEB公司市場部的余。
生物通:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒的*之處在哪里?
NEB:EpiMark 5-hmC 和 5-mC 分析試劑盒能夠在特定的基因位點上識別并定量5-hmC和5-mC,是*個研究、區(qū)分5-hmC和5-mC的試劑盒。這個三步法試劑盒將會對您研究表觀遺傳學(xué)、DNA甲基化,特別是研究5-hmC有所幫助。
生物通:除了此試劑盒,NEB公司還提供了哪些表觀遺傳學(xué)研究試劑?
NEB:NEB 公司提供一系列甲基化依賴性以及對甲基化呈現(xiàn)不同敏感性的限制性內(nèi)切酶,這類內(nèi)切酶可以將 DNA 切割成適當(dāng)片段,有利于甲基化的分析與研究。MspJI 系列內(nèi)切酶是屬于依賴甲基化和羥基甲基化而發(fā)揮作用的內(nèi)切酶,可以將 DNA 切割成以 5-hmC (5-羥甲基胞嘧啶) 和 5-mC (5-甲基胞嘧啶) 為中心的 32 個堿基片段,通過對這些片段的分離、測序,就能繪制出表觀遺傳學(xué)特定修飾位點圖譜。
NEB 公司還提供多種 DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶,用于基因表達(dá)研究,可以針對 DNA 特定位點進(jìn)行甲基化修飾。特別是 CpG 甲基轉(zhuǎn)移酶尤其適用于研究 CpG 甲基化對基因表達(dá)及功能的影響。
除上所述,NEB 公司還提供各種甲基化和非甲基化修飾的基因組 DNA,可以作為各種表觀遺傳學(xué)研究的對照樣品。
在組蛋白研究方面,NEB 公司還提供各種類型的組蛋白,這些組蛋白均為沒有任何翻譯后修飾的高純度重組蛋白質(zhì),可作為對照底物,研究修飾組蛋白的酶類;同時這些組蛋白還可以聚成八聚體,研究哪些結(jié)合后才能發(fā)揮作用的組蛋白或 DNA。
來源:生物通
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