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溫州醫(yī)科大學(xué)Cell子刊發(fā)表測序新發(fā)現(xiàn)

時間:2016-6-20閱讀:244
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來自溫州醫(yī)科大學(xué)、北京大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院的研究人員通過測序在少牙畸形(Oligodontia)個體中發(fā)現(xiàn)了一些WNT10B突變。這項研究發(fā)布在6月16日的Cell子刊《AJHG》雜志上。

溫州醫(yī)科大學(xué)的蔡濤(Tao Cai)教授和北京大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院的馮海蘭(Hailan Feng)教授是這篇文章的共同通訊作者。

先天性缺牙是人類zui常見的發(fā)育異常性疾病之一。其發(fā)病率為1.6%~20%不等,它可以單獨發(fā)生,也可以和綜合征型伴發(fā)。其中少牙畸形(oligodontia)是一種嚴(yán)重的先天性缺牙亞型,表現(xiàn)為非綜合征型,缺牙數(shù)目在6顆以上, 有文獻(xiàn)報道少牙畸形的發(fā)病率約為0.08%~1.1%。而缺牙數(shù)目少于6顆時通常被稱之為牙齒發(fā)育不全(hypodontia)。

先天性缺牙的發(fā)病原因包括兩個方面:有類似如放射、化療大劑量用藥的環(huán)境因素影響,同時基因的突變與疾病的發(fā)生密切相關(guān)。大部分的病例認(rèn)為先天性缺牙與遺傳因素有關(guān)。近年隨著分子生物學(xué)實驗技術(shù)的不斷進(jìn)步,對人類遺傳性疾病的研究更加深入。牙齒缺失影響患者的咀嚼、發(fā)音功能和顏面美觀,對患者身心健康造成巨大影響,先天性缺牙在中國人中的發(fā)病率較高,但是相關(guān)的遺傳學(xué)研究進(jìn)展較少。

在當(dāng)前的研究中,研究人員通過全外顯子組測序在少牙畸形中國家族中鑒別了致病突變。他們在所有受累家庭成員中檢測到了一種WNT10B雜合錯義突變(c.632G>A [p.Arg211Gln])。通過采用Sanger測序方法測序145位罹患非綜合征型少牙畸形的無關(guān)個體,他們確定了另外3個突變:c.569C>G [p.Pro190Arg]、c.786G>A [p.Trp262∗]和 c.851T>G [p.Phe284Cys]。

有意思地是,分析基因型-表型相關(guān)性揭示出WNT10B突變影響了恒牙,尤其是側(cè)切牙的發(fā)育。此外,功能分析證實在HEPG2上皮細(xì)胞中每個突變都無法正常增強(qiáng)經(jīng)典Wnt信號。值得注意地是,這些突變WNT10B配體無法有效誘導(dǎo)牙髓干細(xì)胞內(nèi)皮分化。

這些研究結(jié)果確定了少牙畸形個體中一些常染色體顯性WNT10B突變,增大了先天性牙發(fā)育不全的范圍,揭示出了在牙髓干細(xì)胞內(nèi)皮分化中減弱的Wnt信號。

外顯子組測序是指利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。由于外顯子組測序只需針對外顯子區(qū)域的DNA即可(例如:人類外顯子組只占人類基因組長度的約1%,但是目前由DNA變異引起的疾病估計有85%以上來自于外顯子組區(qū)域的變異),因此遠(yuǎn)比進(jìn)行全基因組序列測序更簡便、經(jīng)濟(jì)、,其目標(biāo)區(qū)域覆蓋度也更高,便于變異檢測。

來自電子科技大學(xué)、中科院和新加坡國家眼科中心等機(jī)構(gòu)的研究人員對中國漢族組群進(jìn)行外顯子組測序發(fā)現(xiàn),F(xiàn)GD6基因中的一個錯義變異提高了息肉狀脈絡(luò)膜血管病變(polypoidal choroidal vasculopathy,PCV)的風(fēng)險。這一研究發(fā)現(xiàn)發(fā)布在2016年4月18日的Nature Genetics雜志上

來自中山大學(xué)、美國國家心理衛(wèi)生研究院、約翰霍普金斯大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員,通過對腫瘤-正常組織樣本進(jìn)行全基因組和全外顯子組測序,描繪出了食管鱗狀細(xì)胞癌的基因組特征,揭示出了一些導(dǎo)致腫瘤發(fā)生和不良預(yù)后的關(guān)鍵基因。這一研究成果于2016年4月發(fā)布在Cell子刊《AJHG》雜志上(中山大學(xué)Cell子刊發(fā)表癌癥研究新成果)。

來自上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院的研究人員報告稱,她們采用全外顯子及靶向測序技術(shù)鑒別出了ROBO1和ROBO2突變是與骨髓增生異常綜合征(Myelodysplastic Syndrome MDS)疾病進(jìn)展相關(guān)的驅(qū)動子。這一研究成果發(fā)布在2015年11月26日的Nature Communications雜志上。(子科生物(田清清)報道)

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