如今，人們開始利用液體活檢技術(shù)來診斷癌癥，以及監(jiān)測(cè)治療效果，不過靈敏度是個(gè)問題。美國(guó)猶他州大學(xué)和華盛頓大學(xué)的研究人員近日在《PLOS Genetics》上發(fā)表文章，稱來源于腫瘤的DNA片段比來源于正常細(xì)胞的片段要短，這個(gè)特征可用于改善液體活檢。

猶他州大學(xué)的Hunter Underhill及其同事zui早在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的動(dòng)物模型中發(fā)現(xiàn)循環(huán)的腫瘤和正常DNA的差異。將人類GBM細(xì)胞系植入大鼠大腦中，并形成病變。在大鼠中發(fā)現(xiàn)人循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA），但研究人員指出，人腫瘤DNA片段與大鼠正常DNA片段存在大小差異：人ctDNA的長(zhǎng)度約為134 bp，而大鼠游離DNA（cfDNA）長(zhǎng)度則為167 bp。

之后，研究人員又將人肝癌細(xì)胞系植入大鼠。同樣地，他們發(fā)現(xiàn)人ctDNA與大鼠cfDNA之間存在DNA片段大小的差異。這表明，這個(gè)模式可能不限于膠質(zhì)母細(xì)胞瘤，而是ctDNA的一個(gè)普遍特征。

為了確定這是否是物種特異的，于動(dòng)物模型，Underhill及其同事檢測(cè)了黑色素瘤患者的循環(huán)DNA長(zhǎng)度，并將其與健康對(duì)照進(jìn)行比較。通過密度測(cè)定，他們發(fā)現(xiàn)黑色素瘤患者的DNA片段在整體上比較短。

研究人員對(duì)cfDNA水平升高的黑色素瘤患者的樣品進(jìn)行測(cè)序，并將數(shù)據(jù)與健康對(duì)照的cfDNA樣品進(jìn)行比較。同樣地，黑色素瘤患者的片段比對(duì)照要短20 bp。此外，他們還發(fā)現(xiàn)，在黑色素瘤患者的cfDNA中，BRAF V600E等位基因比野生型等位基因更加頻繁地存在。

在15名肺癌患者和9名健康對(duì)照的隊(duì)列中，研究人員通過密度測(cè)定和測(cè)序，同樣發(fā)現(xiàn)肺癌患者的cfDNA比對(duì)照要短。在一個(gè)病例和對(duì)照的子集中，研究人員利用基因捕獲和測(cè)序，發(fā)現(xiàn)更短的片段更容易帶有與肺癌相關(guān)的突變等位基因，如EGFR T790M突變。

為了檢驗(yàn)小片段的富集是否增強(qiáng)了腫瘤DNA的檢測(cè)，Underhill及其同事將4名帶有EGFR T790M突變的肺癌患者和1名健康對(duì)照的游離DNA測(cè)序文庫混合。當(dāng)研究人員分離出比總體長(zhǎng)度短20-50 bp的DNA片段時(shí)，3名肺癌患者的樣品表現(xiàn)出突變等位基因頻率的增加。對(duì)于短片段DNA水平低的患者，這種改變更加明顯。

研究人員認(rèn)為，這些結(jié)果表明，選擇性富集較短的cfDNA有望改善突變等位基因的檢測(cè)，并改善低負(fù)荷腫瘤的檢測(cè)。“靈敏度的飛躍造成了能夠檢測(cè)癌癥和不能檢測(cè)癌癥之間的差異，”Underhill補(bǔ)充道。不過，這背后的機(jī)理還不清楚。

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