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江蘇菲亞生物科技有限公司
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細胞周期的不同階段
2017-3-9 閱讀(720)
從而產(chǎn)生單個細胞類型的準確信息。然而，單細胞轉(zhuǎn)錄組結(jié)構(gòu)的根本復雜性，對于弄懂這些數(shù)據(jù)提出了一個重大挑戰(zhàn)。
利用單細胞基因組學，我們能夠選取一個組織的細胞，根據(jù)它們的表達譜，把它們分成不同的類型，從而確定可能有一系列功能作用的細胞亞型。但是，為了正確地做到這一點，我們需要處理一些混雜因素，直到現(xiàn)在，我們還沒有可靠的方法解決這些混雜因素。
一種組織類型的樣本具有固有的復雜性：一些細胞將會是新的，一些則是舊的，在任何給定的時間點上它們將處于。大多數(shù)細胞類型也有隱藏的亞型，每一種可能具有不同的功能。該研究小組開發(fā)出一種新的單細胞潛變量模型（scLVM），可讓我們檢測和控制隱藏的亞結(jié)構(gòu)，從而使相關(guān)的生物信號更容易識別。
已經(jīng)明確了如何考慮細胞周期階段、測量噪聲或生物學過程這樣的因素，從而可能獲得不同細胞類型和亞型中基因表達的更準確信息。將單細胞分析與統(tǒng)計方法相結(jié)合，可讓我們確定細胞類型，否則它們?nèi)匀徊槐话l(fā)現(xiàn)。
如果你所有的數(shù)據(jù)都來自于單細胞的基因表達，你就需要一種方法來識別和糾正可區(qū)分單個細胞的潛在因素，所以你可以了解其深層的生物學因素。我們的模型解釋了單細胞之間的關(guān)聯(lián)性，例如它們是否處于細胞周期的相同階段，識別可能混雜的變量，并去除它們。這也使我們更容易發(fā)現(xiàn)新的細胞亞型——你可能不知道已存在的變量，然后一并糾正它們。
