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MitoTracker Green FM是線粒體綠色熒光染料，這種染料定位于線粒體的能力看起來不受線粒體膜電位影響。該染料可以對活細胞進行染色，但是乙醛固定后不能穩(wěn)定保存。MitoTracker Green FM也可以用來對固定細胞的線粒體進行染色。
MitoTracker Red CM-H₂XRos是MitoTracker Red (M-7512)的非熒光還原態(tài)，在氧化時才會發(fā)出熒光。該染料也可以對活細胞線粒體進行染色并且其積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。
MitoTracker® Deep Red FM是一種遠紅熒光染料（吸收波長/發(fā)射波長約為640/662 nm），用于對活細胞線粒體進行染色，并且該染料的積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。
MitoTracker Red CMXRos是一種紅色熒光染料，用于對活細胞線粒體進行染色，并且該染料的積累取決于膜電位。乙醛固定后，該染料可穩(wěn)定保存。