蛋白質(zhì)由許多氨基酸鏈組成，每一種氨基酸鏈都會(huì)制造出一種名為功能性基序的短鏈氨基酸序列，當(dāng)功能性基序被修飾時(shí)，產(chǎn)生的突變就會(huì)影響疾病的發(fā)展，比如癌癥等疾病。驗(yàn)證蛋白質(zhì)的可能性改變是深入理解其功能的*步，人類機(jī)體的蛋白質(zhì)組是由4萬(wàn)個(gè)蛋白組成，因此尋找每一種蛋白的突變將是一項(xiàng)非常艱巨的任務(wù)。

這就是為何科學(xué)家開始尋找生物信息學(xué)工具進(jìn)行研究的原因，來(lái)自巴斯克地區(qū)大學(xué)的研究者此前開發(fā)了一種名為WREGEX的軟件，其可以幫助預(yù)測(cè)并自動(dòng)搜尋功能性的基序；研究者檢測(cè)了這種軟件預(yù)測(cè)基序的能力，基序可以將蛋白質(zhì)從細(xì)胞核移動(dòng)到細(xì)胞質(zhì)中；如今研究人員想知道哪種蛋白質(zhì)氨基酸序列中含有功能性的癌癥突變基序。

刊登在Scientific Reports雜志上的一篇研究報(bào)告中，研究人員結(jié)合COSMIC目錄中所有已知的人類蛋白質(zhì)序列信息，并對(duì)相關(guān)信息進(jìn)行了分許，COSMIC目錄中收集了和癌癥相關(guān)的突變，因此，基于版本的WREGEX 2.0軟件，研究者就可以將正常蛋白同相同的突變體進(jìn)行對(duì)比來(lái)幫助預(yù)測(cè)可以被修飾的蛋白質(zhì)功能基序以及和癌癥相關(guān)的功能基序。

研究者Gorka Prieto說(shuō)道，你或許想知道基序發(fā)揮功能的機(jī)制，并且發(fā)現(xiàn)是否蛋白質(zhì)的修飾和癌癥相關(guān)，如今利用我們開發(fā)的新型軟件或許就可以達(dá)到這些目的。文章中研究人員開發(fā)的新型工具結(jié)合了三種類型的信息，即蛋白質(zhì)序列、功能基序及癌癥突變，WREGEX 2.0軟件的一個(gè)主要特性就是其可以同時(shí)研究攜帶大量蛋白質(zhì)信息的高復(fù)復(fù)雜的蛋白質(zhì)組，并且結(jié)合相關(guān)的信息，比如癌癥突變信息等。

利用新型軟件的優(yōu)勢(shì)就是可以在1分鐘之內(nèi)完成對(duì)4萬(wàn)個(gè)蛋白的分析，而其它軟件程序分析單一蛋白都需要花費(fèi)幾分鐘時(shí)間。利用這種新型軟件科學(xué)家們或許就可以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的改變?nèi)绾斡绊懚喾N疾病的發(fā)生，而不僅僅是癌癥。截至目前為止，來(lái)自中國(guó)、日本、德國(guó)等地的13個(gè)研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)開始使用這種計(jì)算機(jī)工具，同時(shí)研究者希望后期可以進(jìn)行更為深入的研究來(lái)改善這種工具的工作效率。