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聚合酶鏈反應實驗室又稱基因擴增實驗室,是聚合酶鏈反應(PolymeraseChainReaction)的大特定的脫氧核糖核酸片段,可視為生物體外的特殊脫氧核糖核酸復制。通過脫氧核糖核酸基因跟蹤系統(tǒng),可以快速掌握患者體內(nèi)的病毒含量,其準確性高達納米水平,準確檢測乙肝病毒在患者體內(nèi)的數(shù)量、復制性、感染性、感染性、需要服藥、肝功能異常變化,pcr實驗室設(shè)計可以及時判斷患者使用哪種抗病物,判斷藥物的療效,為臨床治療提供可靠的檢驗依據(jù)。
聚合酶鏈反應器是分子生物學研究和實驗的常規(guī)方法,廣泛應用于生物學的各個領(lǐng)域,如、乙肝、禽疫病、癌基因檢測和診斷、脫氧核糖核酸指紋、個人識別、親子鑒定和法醫(yī)物證、動植物檢疫、動物及其衍生產(chǎn)品檢測、動物飼料、化妝品、食品衛(wèi)生檢測、轉(zhuǎn)基因作物和轉(zhuǎn)基因微生物檢測等。
標準PCR實驗室分為四個區(qū)域:試劑儲存和準備區(qū)、樣品處理區(qū)、核酸擴展區(qū)和產(chǎn)品分析區(qū)。為了避免交叉污染,進入各工作區(qū)域必須嚴格遵循單向方向,即只能從試劑儲存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴展反應混合物準備和擴展區(qū)→擴展產(chǎn)品分析區(qū)實驗區(qū)之間的試劑和樣品傳遞應通過傳遞窗口進行。
聚合酶鏈反應實驗室可分散或組合。完成一組聚合酶鏈反應實驗通常需要四個實驗過程:試劑準備、樣品處理、核酸擴散和產(chǎn)物分析。
分散式PCR實驗室:
所謂分散式PCR實驗室,是指完成上述實驗過程的實驗室相距較遠,呈分散式布局。對于這種布局形式的PCR實驗室,由于各實驗不易相互干擾,不需要特殊條件。
組合式PCR實驗室:
所謂組合式PCR實驗室,是指完成PCR四個實驗過程的實驗室相鄰布置,形成獨立的實驗區(qū)域。對于組合式PCR實驗室,由于各實驗室集中布置,容易造成相互干擾,對整體布局和屏障系統(tǒng)有一定要求。每個房間在入口處設(shè)置緩沖室,減少室內(nèi)外空氣交換。
PCR實驗室的主要功能。
1.試劑儲存和準備區(qū)的作用是:
儲存試劑的制備、試劑的分裝和膨脹反應混合液的準備、離心管、吸頭等消耗品的儲存和準備。儲存試劑和用于標本制備的消耗品等材料應直接運輸?shù)皆噭﹥Υ婧蜏蕚鋮^(qū),不得通過膨脹檢測區(qū)。試劑盒中的陽性對照品和質(zhì)量控制品不應保存在該區(qū)域,應保存在標本處理區(qū)域。
2.標本制備區(qū)的功能如下:
核酸(RNA、DNA)的提取、儲存和添加到擴增反應管中。對于涉及臨床樣品的操作,應符合生物安全二級實驗室保護設(shè)備、個人保護和操作規(guī)范的要求。由于樣品混合和核酸純化過程中可能會發(fā)生氣溶膠造成的污染,可以通過在該區(qū)域設(shè)置正壓條件,避免從鄰近區(qū)域進入該區(qū)域的氣溶膠污染。為了避免樣品之間的交叉污染,添加待測核酸后,必須覆蓋含有反應混合物的反應管。對于有潛在感染危險的材料,必須在生物安全柜中打開蓋子,并有明確的樣品處理和滅活程序。
3.核酸擴增區(qū)的作用是:
脫氧核糖核酸合成、脫氧核糖核酸擴張和檢測。為了避免氣溶膠造成的污染,我們應該盡量減少在該區(qū)域的行走。必須注意的是,所有經(jīng)過測試的反應管不得在該區(qū)域打開。
4.擴大產(chǎn)物分析區(qū)的作用是:
擴展片段的進一步分析和測量,如雜交、酶切電泳、變性高效液相分析、序列測量等。核酸擴展后的產(chǎn)品有多種分析方法,如膜上或微孔板或芯片上的探針雜交方法(放射性核素標記或非放射性核素標記)、直接或酶切后瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳、Southern轉(zhuǎn)移、核酸序列測量方法、質(zhì)譜分析等。
擴展產(chǎn)品分析區(qū)是PCR實驗室最主要的擴展產(chǎn)品污染源,應注意避免通過該區(qū)的物品和工作服將擴展產(chǎn)品帶出。采用PCR-ELISA方法檢測擴展產(chǎn)品時,必須用洗板機清洗板材,廢液必須收集到1mol/LHCl中,且不能在實驗室內(nèi)傾倒,而應遠離PCR實驗室。使用過的吸頭也必須放入1mol/LHCl中浸泡,然后放入垃圾袋中按程序處理,如焚燒。因為這個地區(qū)可能會使用一些可引起基因突變的有毒物質(zhì),如溴化乙錠、丙烯酰胺、甲醛或放射性核素等,所以要注意實驗者的安全保護。
聚合酶鏈反應實驗室設(shè)計的主要依據(jù)和標準。
《醫(yī)療器械生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范附錄體外診斷試劑》、《醫(yī)療器械生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范體外診斷試劑現(xiàn)場檢驗指導原則》中明確規(guī)定了PCR試劑的生產(chǎn)和檢驗環(huán)境。此外,現(xiàn)行衛(wèi)生行業(yè)的法律法規(guī)、標準及相關(guān)文獻規(guī)定了PCR檢驗實驗室,主要涉及《國家臨床檢驗規(guī)程》(第三版)、《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴張管理辦法》、《醫(yī)療機構(gòu)臨床基因擴張檢驗實驗室工作指南》、《聚合酶鏈反應在臨床診斷中的應用》等行業(yè)標準的相關(guān)要求。
PCR實驗室建設(shè)要點。
1是主體結(jié)構(gòu)
主體為潔凈彩色鋼板和鋁合金型材。室內(nèi)外角采用鋁合金50內(nèi)圓角鋁,解決了容易污染、積灰、清洗困難的問題。結(jié)構(gòu)牢固,線條簡潔美觀,密封性能好。
2標準三區(qū)分隔及壓差控制
PCR過程分為三個獨立的實驗區(qū):試劑制備、樣品制備和PCR擴展檢測。整個區(qū)域有一個整體緩沖走廊。每個獨立的實驗區(qū)都有一個緩沖區(qū)。
聚合酶鏈反應實驗室空調(diào)通風系統(tǒng)的設(shè)計和壓力控制聚合酶鏈反應實驗室沒有嚴格的凈化要求,但為了避免各實驗區(qū)間交叉污染的可能性,應采用全排氣流組織形式。同時,應嚴格控制輸送和排氣比例,以確保各實驗區(qū)的壓力要求。
3是消毒
UV燈安裝在三個個實驗區(qū)、三個緩沖區(qū)的頂部和轉(zhuǎn)移窗中消毒。試劑制備區(qū)和標本制備區(qū)還設(shè)有移動紫外線燈,對試驗臺進行局部消毒。
4.機械連鎖不銹鋼傳動窗
試劑和標本通過機械聯(lián)鎖不銹鋼(不推薦電子聯(lián)鎖)傳輸窗口傳輸,保證試劑和標本在傳輸過程中不受污染(人物分流)。
5是地面
地面一般采用聚氯乙烯卷材地板或自流地板,整體性好。易于清潔和耐腐蝕。也可以使用水磨石地板或大瓷磚(至少800毫米×800毫米)接縫應小于2毫米。盡量避免灰塵產(chǎn)生和灰塵積聚。
6是照明
燈具應選擇凈化燈具,便于清潔和清潔。
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