1.按照培養(yǎng)基的成分來分
培養(yǎng)基按其所含成分，可分為合成培養(yǎng)基、天然培養(yǎng)基和半合成培養(yǎng)基三類。
（1）合成培養(yǎng)基。合成培養(yǎng)基的各種成分*是已知的各種化學物質(zhì)。這種培養(yǎng)基的化學成分清楚，組成成分，重復性強，但價格較貴，而且微生物在這類培養(yǎng)基中生長較慢。如高氏一號合成培養(yǎng)基、察氏（Czapek）培養(yǎng)基等。
（2）天然培養(yǎng)基。由天然物質(zhì)制成，如蒸熟的馬鈴薯和普通牛肉湯，前者用于培養(yǎng)霉菌，后者用于培養(yǎng)細菌。這類培養(yǎng)基的化學成分很不恒定，也難以確定，但配制方便，營養(yǎng)豐富，所以常被采用。
（3）半合成培養(yǎng)基。在天然有機物的基礎上適當加入已知成分的無機鹽類，或在合成培養(yǎng)基的基礎上添加某些天然成分，如培養(yǎng)霉菌用的*。這類培養(yǎng)基能更有效地滿足微生物對營養(yǎng)物質(zhì)的需要。
2.按照培養(yǎng)基的物理狀態(tài)分
培養(yǎng)基按其物理狀態(tài)可分為固體培養(yǎng)基、液體培養(yǎng)基和半固體培養(yǎng)基三類。
（1）固體培養(yǎng)基。是在培養(yǎng)基中加入凝固劑，有瓊脂、明膠、硅膠等。固體培養(yǎng)基常用于微生物分離、鑒定、計數(shù)和菌種保存等方面。
（2）液體培養(yǎng)基。液體培養(yǎng)基中不加任何凝固劑。這種培養(yǎng)基的成分均勻，微生物能充分接觸和利用培養(yǎng)基中的養(yǎng)料，適于作生理等研究，由于發(fā)酵率高，操作方便，也常用于發(fā)酵工業(yè)。
（3）半固體培養(yǎng)基。是在液體培養(yǎng)基中加入少量凝固劑而呈半固體狀態(tài)?？捎糜谟^察細菌的運動、鑒定菌種和測定噬菌體的效價等方面。
3.按照微生物的種類分
培養(yǎng)基按微生物的種類可分為細菌培養(yǎng)基、放線菌培養(yǎng)基、酵母菌培養(yǎng)基和霉菌培養(yǎng)基等四類。
常用的細菌培養(yǎng)基有營養(yǎng)肉湯和營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基；常用的放線菌培養(yǎng)基為高氏1號培養(yǎng)基；常用的酵母菌培養(yǎng)基有馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基和麥芽汁培養(yǎng)基；常用的霉菌培養(yǎng)基有馬鈴薯蔗糖培養(yǎng)基、豆芽汁葡萄糖（或蔗糖）瓊脂培養(yǎng)基和察氏培養(yǎng)基等。
4.按照培養(yǎng)基用途分
培養(yǎng)基按其特殊用途可分為加富培養(yǎng)基、選擇性培養(yǎng)基和鑒別培養(yǎng)基。
（1）加富培養(yǎng)基。是在培養(yǎng)基中加入血、血清、動植物組織提取液，用以培養(yǎng)要求比較苛刻的某些微生物。
（2）選擇性培養(yǎng)基。是根據(jù)某一種或某一類微生物的特殊營養(yǎng)要求或?qū)σ恍┪锢?、化學抗性而設計的培養(yǎng)基。利用這種培養(yǎng)基可以將所需要的微生物從混雜的微生物中分離出來。
（3）鑒別培養(yǎng)基。是在培養(yǎng)基中加入某種試劑或化學藥品，使培養(yǎng)后會發(fā)生某種變化，從而區(qū)別不同類型的微生物。
