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實(shí)驗(yàn)原理
熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一門(mén)新興的分子細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù),是20世紀(jì)80年代末期在原有的放射性原位雜交技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一種非放射性原位雜交技術(shù)。目前這項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物基因組結(jié)構(gòu)研究、染色體精細(xì)結(jié)構(gòu)變異分析、病毒感染分析、人類產(chǎn)前診斷、腫瘤遺傳學(xué)和基因組進(jìn)化研究待許多領(lǐng)域。FISH的基本原理是用已知的標(biāo)記單鏈核酸為探針,按照堿基互補(bǔ)的原則,與待檢材料中未知的單鏈核酸進(jìn)行異性結(jié)合,形成可被檢測(cè)的雜交雙鏈核酸。由于DNA分子在染色體上是沿著染色體縱軸呈線性排列,因而可以探針直接與染色體進(jìn)行雜交從而將特定的基因在染色體上定位。與傳統(tǒng)的放射性標(biāo)記原位雜交相比,熒光原位雜交具有快速、檢測(cè)信號(hào)強(qiáng)、雜交特異性高和可以多重染色等特點(diǎn),因此在分子細(xì)胞遺傳學(xué)領(lǐng)域受到普遍關(guān)注。
雜交所用的探針大致可以分類三類:1)染色體特異重復(fù)序列探針,例如α衛(wèi)星、衛(wèi)星III類的探針,其雜交靶位常大于1Mb,不含散在重復(fù)序列,與靶位結(jié)合緊密,雜交信號(hào)強(qiáng),易于檢測(cè);2)全染色體或染色體區(qū)域特異性探針,其由一條染色體或染色體上某一區(qū)段上不同的核苷酸片段所組成,可由克隆到噬菌體和質(zhì)粒中的染色體特異大片段獲得;3)特異性位置探針,由一個(gè)或幾個(gè)克隆序列組成。
探針的熒光素標(biāo)記可以采用直接和間接標(biāo)記的方法。間接標(biāo)記是采用*標(biāo)記DNA探針,雜交之后用藕聯(lián)有熒光素親和素或者鏈霉親和素進(jìn)行檢測(cè),同時(shí)還可以利用親和素-*-熒光素復(fù)合物,將熒光信號(hào)進(jìn)行放大,從而可以檢測(cè)500bp的片段。而直接標(biāo)記法是將熒光素直接與探針核苷酸或磷酸戊糖骨架共價(jià)結(jié)合,或在缺口平移法標(biāo)記探針時(shí)將熒光素核苷三磷酸摻入。直接標(biāo)記法在檢測(cè)時(shí)步驟簡(jiǎn)單,但由于不能進(jìn)行信號(hào)放大,因此靈敏度不如間接標(biāo)記的方法。
實(shí)驗(yàn)用具及材料
相關(guān)溶液的配制
1)20×SSC:175.3g NaCl,88.2g檸檬酸鈉,加水至1000mL(用10mol/L NaOH調(diào)pH 至7.0)。
2)去離子甲酰胺(DF):將10g混合床離子交換樹(shù)脂加入100mL甲酰胺中。電磁攪拌30min,用Whatman l號(hào)濾紙濾。
3)體積分?jǐn)?shù)70%甲酰胺/2×SSC:35mL甲酰胺,5mL 20×SSC,10mL水。
4)體積分?jǐn)?shù)50%甲酰胺/2×SSC:100mL甲酰胺,20mL 20×SSC,80mL水。
5)體積分?jǐn)?shù)50%硫酸葡聚糖(DS):65oC水浴中融化,4oC或-20oC保存。
6)雜交液:8µL體積分?jǐn)?shù)25%DS,20µL 20×SSC混合。(或40µL體積分?jǐn)?shù)50%DS,20µL 20×SSC,40µL ddH2O混合)取上述混合液50µL,與5µL DF混合即成。其終濃度為體積分?jǐn)?shù)10%DS,2×SSC,體積分?jǐn)?shù)50%DF。
7)PI/antifade溶液
PI原液:先以雙蒸水配置溶液,濃度為100µg/mL,取出1mL,加39mL雙蒸水,使終濃度為2.5µg/mL。Antifade原液:以PBS緩沖液配制該溶液,使其濃度為10mg/mL,用0.5mmol/L的NaHCO3調(diào)pH值為8.0。取上述溶液1mL,加9mL甘油,混勻。
PI/antifade溶液:PI與antifade原液按體積比1:9比例充分混勻,-20oC保存?zhèn)溆谩?/p>
8)DAPI/antifade溶液:用去離子水配制1mL/mg DAPI儲(chǔ)存液,按體積比1:300,以antifade溶液稀釋成工作液。
9)封閉液I:體積分?jǐn)?shù)5%BSA 3mL,20×SSC 1mL,ddH2O 1mL,Tween20 5µL混合。
10)封閉液II:體積分?jǐn)?shù)5% BSA 3mL,20×SSC 1mL,goat serum 250µL,ddH2O 750µL,Tween20 5µL混合。
11)熒光檢測(cè)試劑稀釋液:體積分?jǐn)?shù)5% BSA 1mL,20×SSC 1mL,ddH2O 3mL,Tween20 5µL混合。
12)洗脫液:100mL 20×SSC,加水至500mL,加Tween20 500µL。
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