新風機組控制包括：送風溫度控制、送風相對濕度控制、防凍控制、CO2濃度控制以及各種聯(lián)鎖內(nèi)容。如果新風機組要考慮承擔室內(nèi)負荷（如直流式機組），則還要控制室內(nèi)溫度（或室內(nèi)相對濕度）。
1. 送風溫度控制
送風溫度控制即是出風溫度控制，其適用條件通常是該新風機組是以滿足室內(nèi)衛(wèi)生要求而不是負擔室內(nèi)負荷來使用的。因此，在整個控制時間內(nèi)，其送風溫度以保持恒定值為原則。由于冬、夏季對室內(nèi)要求不同，因此冬、夏季送風溫度應有不同的要求。也即是說，新風機組定送風溫度控制時，全年有兩個控制值——冬季控制值和夏季控制值，因此必須考慮控制器冬、夏工況的轉(zhuǎn)換問題。
送風溫度控制時，通常是夏季控制冷盤管水量，冬季控制熱盤管水量或蒸汽盤管的蒸汽流量。為了管理方便，溫度傳感器一般設于該機組所在機房內(nèi)的送風管上。
2. 室內(nèi)溫度控制
對于一些直流式系統(tǒng)，新風不僅能使環(huán)境滿足衛(wèi)生標準，而且還可承擔全部室內(nèi)負荷。由于室內(nèi)負荷是變化的，這時采用控制送風溫度的方式必然不能滿足室內(nèi)要求（有可能過熱或過冷）。因此必須對使用地點的溫度進行控制。由此可知，這時必須把溫感器設于被控房間的典型區(qū)域。由于直流系統(tǒng)通常設有排風系統(tǒng)，溫感器設于排風管道并考慮一定的修正也是一種可行的辦法。
除直流式系統(tǒng)外，新風機組通常是與風機盤管一起使用的。在一些工程中，由于考慮種種原因（如風機盤管的除濕能力限制等），新風機組在設計時承擔了部分室內(nèi)負荷，這種做法對于設計狀態(tài)時，新風機組按送風溫度控制是不存在問題的。但當室外氣候變化而使得室內(nèi)達到熱平衡時（如過渡季的某些時間），如果繼續(xù)控制送風溫度，必然造成房間過冷（供冷水工況時）或過熱（供熱水工況時），這時應采用室內(nèi)溫度控制。因此，這種情況下，從全年運行而言，應采用送風溫度與室內(nèi)溫度的聯(lián)合控制方式。
