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當(dāng)前位置:齊一生物科技(上海)有限公司>>技術(shù)文章>>樟科植物 DNA 條形碼研究取得進(jìn)展
基于 BLAST 和 NJ 樹的分析,單片段與組合片段在種水平和屬水平的鑒定能力統(tǒng)計(jì)(A: n ≥ 1; B: n ≥ 2)
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樟科植物作為常見的重要經(jīng)濟(jì)林木,在林業(yè)、輕工、醫(yī)藥等領(lǐng)域都占有重要的地位,大多數(shù)種類集中分布于長江以南各省區(qū),然而對(duì)其物種的把握與識(shí)別卻始終是困擾大家的一個(gè)難題,阻礙了對(duì)其實(shí)施有效的生物多樣性保護(hù)與開發(fā)利用。物種的準(zhǔn)確鑒定是一切生產(chǎn)、應(yīng)用與研究至關(guān)重要的*步,DNA 條形碼技術(shù)的應(yīng)用,使得前述難題都有方法可循。
為了探尋與評(píng)估 DNA 條形碼技術(shù)對(duì)這一難題的解決能力,中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園植物系統(tǒng)發(fā)育與保護(hù)研究組研究員李捷指導(dǎo)的博士研究生劉志芳和慈秀芹利用該研究組在樟科植物分類與系統(tǒng)學(xué)方面近二十年的研究與積累,將 DNA 條形碼技術(shù)與樟科形態(tài)學(xué)特征相結(jié)合,分別從條形碼的鑒定能力、物種糾錯(cuò)能力和系統(tǒng)演化等三個(gè)方面進(jìn)行了分析與探討。研究發(fā)現(xiàn),條形碼組織的核心條形碼 matK 和 rbcL 與補(bǔ)充條形碼 trnH-psbA、ITS 和 ITS2,除對(duì)基部的部分類群有好的鑒定表現(xiàn)外,整體上對(duì)樟科植物的物種鑒定能力較弱;但是條形碼 ITS,如果不考慮序列的擴(kuò)增與測(cè)序困難問題,其鑒定能力較佳,作為樟科植物的有力條形碼;條形碼技術(shù)與形態(tài)鑒定相結(jié)合,對(duì)樟科物種鑒定糾錯(cuò)率高達(dá) 10.8%;條形碼數(shù)據(jù)可以一定程度地重建樟科植物的系統(tǒng)演化。此項(xiàng)研究對(duì)林業(yè)、輕工、醫(yī)藥領(lǐng)域利用樟科植物資源具有較高的參考價(jià)值,對(duì)樟科植物的分類與系統(tǒng)發(fā)育研究以及種質(zhì)資源保護(hù)也有重要的意義,同時(shí)該研究也為正在開展的東南亞等地區(qū)樟科植物調(diào)查提供了數(shù)據(jù)參考。
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