鑒定與疾病相關(guān)聯(lián)的蛋白難度頗高，因為樣品中的少數(shù)幾種高豐度蛋白在總蛋白中占了很大的比例。以臨床研究中常用的血清和血漿為例，蛋白濃度范圍跨越了11個數(shù)量級。而且，20種zui高豐度的蛋白占據(jù)了總蛋白量的97-99%。如此一來，有價值的生物標(biāo)志物就變得難以尋覓了。

如何打倒高豐度蛋白這個巨人，發(fā)現(xiàn)其身后躲藏的低豐度蛋白呢？Bio-Rad公司開發(fā)出ProteoMiner蛋白富集技術(shù)，能夠降低高豐度蛋白的水平，助您發(fā)現(xiàn)低豐度蛋白的秘密。關(guān)于此項技術(shù)，生物通之前曾做過詳細(xì)報道，請看《揭開低豐度蛋白的秘密》這篇文章。如今，這項技術(shù)已經(jīng)走向，應(yīng)用在多個蛋白質(zhì)組學(xué)實驗室中。這一次，Bio-Rad公司請來三位蛋白質(zhì)組學(xué)方面的專家，談?wù)勊麄兪侨绾螒?yīng)用ProteoMiner技術(shù)的。

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Stefan Lehr博士（德國）——發(fā)現(xiàn)糖尿病診斷的生物標(biāo)志物

德國糖尿病中心30多年來一直將的技術(shù)、研究行動與病人關(guān)懷融合，以求闡明疾病的方方面面。他們的目標(biāo)是：了解疾病的生理機(jī)制，減少糖尿病相關(guān)的并發(fā)癥，并改善患者的治療。

正是這種從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化，吸引了Stefan Lehr博士在獲得博士學(xué)位之后加入了該中心。Lehr的研究生階段是在科隆大學(xué)度過的，他的研究方向是信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和胰島素受體的磷酸化。經(jīng)過多年的鍛煉，他對質(zhì)譜、2-D電泳以及亞細(xì)胞分部等復(fù)雜的實驗室技術(shù)非常精通。Lehr認(rèn)識到II型糖尿病是一種發(fā)病率逐年提高的疾病，于是他建立了一個蛋白質(zhì)組學(xué)實驗室。

如今，Lehr仍然在使用技術(shù)來分析與II型糖尿病相關(guān)的蛋白模式。研究的一個方面是分析人類血清樣本，以了解疾病的分子發(fā)病機(jī)理。在使用2-D差異凝膠電泳時，他面臨的干擾也是高豐度蛋白。“大的斑點遮蔽了小的斑點。傳統(tǒng)方法需要好幾步，有時可能會丟失蛋白，”Lehr認(rèn)為。

這個挑戰(zhàn)激發(fā)了Lehr對Bio-Rad ProteoMiner蛋白富集技術(shù)的興趣。之后，Lehr就開始用人類血清來檢驗這項技術(shù)。初期檢測表明人類血清也能進(jìn)行蛋白質(zhì)圖譜分析。隨后，研究小組設(shè)計實驗，來評估重復(fù)性和變異性，以及與下游方法的兼容性。Lehr強(qiáng)調(diào)關(guān)鍵是在重復(fù)性。

隨著驗證實驗的成功完成，Lehr計劃將ProteoMiner蛋白富集技術(shù)融入他的流程之中，作為低豐度蛋白的一步分部法。他希望由此鑒定出II型糖尿病早期階段的生物標(biāo)志物。糖尿病的診斷通常是在發(fā)作幾年后。Lehr希望疾病的早期診斷能夠預(yù)防相關(guān)的并發(fā)癥，比如心肌梗塞和中風(fēng)，并顯著降低治療的費用。來源：生物通