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Cell封面:4篇文章聚焦基因調(diào)控新假說

時間:2011-10-17閱讀:639
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哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院的癌癥遺傳學(xué)家Pier Paolo Pandolfi在今年7月Cell雜志上發(fā)表了一篇題為“A ceRNA Hypothesis: The Rosetta Stone of a Hidden RNA Language?”的文章,引起了科學(xué)界的高度關(guān)注。

在這篇文章中Pandolfi等人提出了ceRNA(competing endogenous RNA,競爭性內(nèi)源RNA)調(diào)控基因表達(dá)的假說,認(rèn)為這種ceRNA活性能形成一種大規(guī)模轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),擴(kuò)大人類基因組中的功能性遺傳信息。并通過miRNAs應(yīng)答元件,作為mRNAs轉(zhuǎn)錄假基因,以及長鏈非編碼RNAs相互“交流”的新語言。Pandolfi等人還認(rèn)為ceRNA活性也在病理?xiàng)l件,比如癌癥中扮演了重要角色,這對于解開一些癌癥研究之謎具有非常重要的意義。

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近日來自哈佛醫(yī)學(xué)院,哥倫比亞大學(xué)和羅馬*大學(xué)的三個研究小組從多個方面對Pandolfi的基因調(diào)控假說進(jìn)行了驗(yàn)證,4篇研究論文同期發(fā)布出版(10月14日)的《Cell》雜志上,并被選為封面故事。

Coding-Independent Regulation of the Tumor Suppressor PTEN by Competing Endogenous mRNAs

在這篇文章中哈佛醫(yī)學(xué)院貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心的研究人員以關(guān)鍵腫瘤抑制因子PTEN為研究對象檢驗(yàn)了Pandolfi的基因調(diào)控假說。研究人員采用實(shí)驗(yàn)檢測結(jié)合計(jì)算分析的方法鑒別出了候選的ceRNAs,并證實(shí)這些ceRNAs可以miRNA依賴的方式調(diào)控細(xì)胞內(nèi)PTEN 和 P-Akt蛋白水平。尤其值得關(guān)注的是,研究人員發(fā)現(xiàn)在癌癥中編碼這些PTEN ceRNAs的基因發(fā)生了缺失,表明它們具有重要的腫瘤抑制功能。

An Extensive MicroRNA-Mediated Network of RNA-RNA Interactions Regulates Established Oncogenic Pathways in Glioblastoma

在這篇文章中,來自格倫比亞大學(xué)的研究人員基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)及配對的miRNA圖譜繪制出了惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞中由超過248,000種miRNA介導(dǎo)的大型RNA互作網(wǎng)絡(luò)。其中有超過7000種基因編碼RNA以借助miRNA的方式發(fā)生了相互作用。生化分析結(jié)果表明這些ceRNA互作對與癌癥相關(guān)的基因起著重要的調(diào)控作用。

In Vivo Identification of Tumor- Suppressive PTEN ceRNAs in an Oncogenic BRAF-Induced Mouse Model of Melanoma

在這篇文章中,來自哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員利用一種“睡美人”轉(zhuǎn)座子插入誘變的黑色素模型小鼠篩查出了幾個假定PTEN ceRNAs,并對這些假定PTEN ceRNAs進(jìn)行了功能驗(yàn)證。研究人員發(fā)現(xiàn)其中的PTEN ceRNA ZEB2以一種miRNA依賴的方式調(diào)控了PTEN蛋白水平。PTEN ceRNA ZEB2缺失可導(dǎo)致PI3K/AKT信號激活,促使細(xì)胞發(fā)生轉(zhuǎn)化,誘導(dǎo)腫瘤發(fā)生。

A Long Noncoding RNA Controls Muscle Differentiation by Functioning as a Competing Endogenous RNA

在這篇文章中,來自羅馬*大學(xué)的研究人員證實(shí)一種在成肌細(xì)胞分化過程中特異性表達(dá)的胞質(zhì)長鏈非編碼RNA—— linc-MD1可發(fā)揮ceRNA活性,通過miR-133 和 miR-135實(shí)現(xiàn)對肌肉特異性基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子MAML1 和 MEF2C的表達(dá)調(diào)控。linc-MD1的表達(dá)抑制可導(dǎo)致成肌細(xì)胞分化延遲,與杜氏肌營養(yǎng)不良癥的發(fā)病密切相關(guān)。這一研究表明ceRNA網(wǎng)絡(luò)在肌細(xì)胞分化過程中發(fā)揮了極其重要的作用。

來源:生物通

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