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近年Science、Nature熱門(mén)細(xì)胞研究話題大盤(pán)點(diǎn)

時(shí)間:2016/6/7閱讀:634
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近年來(lái),生命科學(xué)研究工具不斷推陳出新,新一代的測(cè)序、成像、自動(dòng)化檢測(cè)等技術(shù)革新了整個(gè)生命科學(xué)行業(yè)的認(rèn)知維度,不僅使得經(jīng)久不衰的科研話題獲得新的突破,如細(xì)胞間相互作用、自噬和細(xì)胞信號(hào)通路等,同時(shí)也為一些過(guò)去無(wú)法解決的難題提供了新思路,例如癌癥新療法CAR-T。本文精選了Nature、Science等高分文獻(xiàn),探討新一代的成像流式技術(shù)在如下熱門(mén)話題中的應(yīng)用。

免疫細(xì)胞吞噬

細(xì)胞間相互作用一直是免疫學(xué)中的熱點(diǎn)。免疫細(xì)胞可以吞噬靶細(xì)胞從而實(shí)現(xiàn)自我修復(fù)的功能,也可以通過(guò)受體配體結(jié)合實(shí)現(xiàn)不同細(xì)胞間的物質(zhì)交換。由于傳統(tǒng)方法無(wú)法對(duì)單個(gè)細(xì)胞成像,因此細(xì)胞間相互作用的方式一直缺乏直觀有效地證據(jù)。在2009年4月16日,David Sancho等人在Nature上發(fā)表了一篇題為“Identification of a dendritic cell receptor that couples sensing of necrosis to immunity”的文章,成功的證實(shí)了樹(shù)突狀細(xì)胞通過(guò)SKY耦合C型凝集素受體CLEC9A識(shí)別并吞噬壞死細(xì)胞,并且采用量化成像流式技術(shù)識(shí)別并量化統(tǒng)計(jì)的細(xì)胞吞噬的情況。

圖1:通過(guò)左側(cè)成像流式結(jié)果圖可以清楚的判別細(xì)胞黏連體(’False’ postive)和發(fā)生吞噬的細(xì)胞(’True’ positive),從而排除了假陽(yáng)性結(jié)果的干擾。
 
信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)

除了免疫細(xì)胞的吞噬之外,細(xì)胞間的相互作用還包括不同細(xì)胞通過(guò)配體受體的結(jié)合進(jìn)行細(xì)胞間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。zui常見(jiàn)的是獲得性免疫反應(yīng)中,T淋巴細(xì)胞與抗原遞呈細(xì)胞之間免疫突觸的形成。在正常細(xì)胞中,與免疫突觸形成相關(guān)的蛋白淋巴細(xì)胞功能相關(guān)抗原-1(LFA-1),細(xì)胞表面抗原CD3,以及F-actin均勻分布在細(xì)胞表面;而當(dāng)免疫突出形成時(shí),這些蛋白在兩個(gè)細(xì)胞接觸的位置發(fā)生凝集。正是根據(jù)這一機(jī)制,2009年,Babak H. Hosseini等人成功的使用成像流式技術(shù)檢測(cè)到HEL多肽處理細(xì)胞可以促進(jìn)免疫突觸的形成,并將科研成果發(fā)表在PNAS上。由此也證明成像流式在檢測(cè)免疫突觸形成中*的優(yōu)勢(shì)。

圖2:圖2A顯示,未使用HEL多肽處理的樣本中LFA-1,CD3和F-actin并沒(méi)有發(fā)生凝集,因此沒(méi)有免疫突觸形成。細(xì)胞經(jīng)過(guò)HEL多肽處理后,LFA-1,CD3和F-actin并發(fā)生凝集,證明有免疫突觸形成。圖2B的量化統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,HEL多肽促進(jìn)免疫突觸形成的結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
 
自噬

自噬是細(xì)胞在演變進(jìn)化的過(guò)程中保留下來(lái)的一個(gè)分解代謝過(guò)程,其主要是將胞漿內(nèi)的物質(zhì)運(yùn)輸?shù)饺苊阁w內(nèi)進(jìn)而被分解代謝,藉此實(shí)現(xiàn)細(xì)胞本身的代謝需要和某些細(xì)胞器的更新。研究自噬的傳統(tǒng)方法主要是通過(guò)熒光顯微鏡或者共聚焦觀察自噬小體/自噬溶酶體的形成。由于顯微鏡的視野限制,無(wú)法進(jìn)行高通量樣本或者混合細(xì)胞樣本,比如臨床血液樣本進(jìn)行分析。2012年,Kanchan Phadwal等人在《Autography》發(fā)表題為“A novel method for autophagy detection in primary cells”使用量化成像流式技術(shù)對(duì)人血中白細(xì)胞旳自噬進(jìn)行了量化分析,并且通過(guò)對(duì)原代細(xì)胞和細(xì)胞系自噬的相關(guān)基因的研究,證實(shí)了T體細(xì)胞的自噬活性明顯高于B細(xì)胞,而隨著DNA損傷水平的升高CD8+ T細(xì)胞的自噬明顯下降。從而為隨著年齡的增長(zhǎng),免疫系統(tǒng)功能下降提供了合理的解釋。

圖3:由圖可以看出,發(fā)生自噬的細(xì)胞LC3在細(xì)胞內(nèi)發(fā)生的聚集,因此在細(xì)胞內(nèi),熒光信號(hào)為散點(diǎn)。加了抑制劑(Basal+I)后,自噬被抑制,因此LC3在細(xì)胞內(nèi)是彌散分布的。

CAR-T免疫療法

新型抗腫瘤藥一直都是各大藥企的研發(fā)重點(diǎn)。目前臨床使用的抗癌藥物大多數(shù)為化學(xué)藥,這類藥物由于靶向性差導(dǎo)致患者常常會(huì)出現(xiàn)嚴(yán)重的不良反應(yīng)以及耐藥性。盡管藥企投入了大量的人力物力,但是不得不承認(rèn)傳統(tǒng)化學(xué)類抗腫瘤藥物的研發(fā)遇到了瓶頸。越來(lái)越多的科研人員把目光投向了免疫治療,因此嵌合抗原受體T細(xì)胞免疫療法(CAR-T)成為科研界的“寵兒”。不幸的是腫瘤表達(dá)的大多數(shù)抗原不具備腫瘤特異性,因此大多數(shù)的CAR都以腫瘤相關(guān)性抗原作為靶點(diǎn),但這往往會(huì)導(dǎo)致“脫靶”的可能性。同時(shí)對(duì)于相關(guān)的抗原選擇也需要選擇細(xì)胞表面抗原,以避免CAR-T脫靶的可能。因此尋找腫瘤特異性的細(xì)胞表面抗原成為CAR-T研究的關(guān)鍵。Bryan W. Day等人發(fā)現(xiàn)受體酪氨酸激酶在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)病人中EphA3過(guò)表達(dá)并且通過(guò)調(diào)節(jié)有絲分裂原激活蛋白激酶信號(hào)通路減少腫瘤細(xì)胞的分化。幸運(yùn)的是,作者通過(guò)量化成像流式技術(shù)檢測(cè)到EphA3為細(xì)胞膜蛋白,這一發(fā)現(xiàn)為后續(xù)的CAR-T研究提供了潛在的治療靶點(diǎn)。

圖4:由成像流式圖像可以看到標(biāo)記熒光的EphA3的分布區(qū)域,主要在細(xì)胞膜上,且在Integrin α6和CD133陽(yáng)性的細(xì)胞中高表達(dá)。 對(duì)這些細(xì)胞進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,證實(shí)EphA3高表達(dá)是有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的。

盡管傳統(tǒng)化學(xué)類抗腫瘤藥物的研發(fā)遇到了瓶頸,但是由于化學(xué)修飾相對(duì)簡(jiǎn)單方便,并且經(jīng)化學(xué)修飾過(guò)的抗原抗體特異性和親和力都會(huì)有所提高;因此,在CAR-T的研究中化學(xué)修飾依舊有著很大的應(yīng)用潛力。耶魯大學(xué)的Patrick J. McEnaney等人設(shè)計(jì)合成了一類被稱為“synthetic antibody mimics targeting prostate cancer (SyAM-P)”的化合物,這類中等分子量(~ 7000 Da)的化合物同時(shí)具有抗體的結(jié)合與效應(yīng)能力,因此可以有效的將免疫細(xì)胞和前列腺癌細(xì)胞特異性地結(jié)合在一起,從而增強(qiáng)免疫細(xì)胞對(duì)癌細(xì)胞的特異性識(shí)別和吞噬。這一發(fā)現(xiàn)于2014年12月16日發(fā)表在化學(xué)類的雜志JACS上,為CAR-T的研究提供了新思路。

 

圖5:通過(guò)成像流式可區(qū)分發(fā)生吞噬的細(xì)胞,吞噬形成圖(右下)顯示SyAM-P可以幫助免疫細(xì)胞識(shí)別癌細(xì)胞;吞噬完成圖(右上)證明免疫細(xì)胞可以吞噬癌細(xì)胞。左圖量化分析顯示此結(jié)果是有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

綜上所述,我們不難發(fā)現(xiàn),單一的圖像或者單一的群體統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)無(wú)法滿足科研的需要。尤其是在醫(yī)療飛速發(fā)展的時(shí)代,科學(xué)家們要獲得質(zhì)量更高、更為可信的數(shù)據(jù),為臨床的診斷和治療提供有力的支持。因此不僅需要科研工作者們將個(gè)體數(shù)據(jù)與群體數(shù)據(jù)的有機(jī)結(jié)合,還要通過(guò)“眼見(jiàn)為實(shí)”的圖像證實(shí)所獲得的統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果是有意義的。量化成像流式技術(shù)將流式細(xì)胞檢測(cè)與熒光顯微成像結(jié)合于一體,既能提供細(xì)胞群的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),又可以獲得單個(gè)細(xì)胞的圖像,從而提供了細(xì)胞形態(tài)學(xué)、細(xì)胞結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞信號(hào)分布的完整信息,這預(yù)示著該技術(shù)在未來(lái)科研領(lǐng)域中無(wú)限的應(yīng)用潛力!

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