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上海莼試生物技術(shù)有限公司

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豬痢疾短螺旋體PCR檢測試劑盒檢測常見問題原因

2020-6-16  閱讀(136)

豬痢疾短螺旋體PCR檢測試劑盒檢測常見問題原因

1. cDNA產(chǎn)量的很低可能的原因:

1) RNA模板質(zhì)量低

2) 對(duì)mRNA濃度估計(jì)過高

3)反應(yīng)體系中存在反轉(zhuǎn)錄酶抑制劑或反轉(zhuǎn)錄酶量不足

4)同位素磷32過期

5)反應(yīng)體積過大,不應(yīng)超過50μl

2. 擴(kuò)增產(chǎn)物在電泳分析時(shí)沒有條帶或條帶很淺

1)zui常見的原因在于您的反應(yīng)體系是PCR的反應(yīng)體系而不是RT-PCR的反應(yīng)體系

3) 與反應(yīng)起始時(shí)RNA的總量及純度有關(guān)

4) 建議在試驗(yàn)中加入對(duì)照RNA

5) 一鏈的反應(yīng)產(chǎn)物在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),在總的反應(yīng)體系中的含量不要超過1/10

6) 建議用Oligo(dT)或隨機(jī)引物代替基因特異性引物(GSP)用于一鏈合成。由于RNA模板存在二級(jí)結(jié)構(gòu),如環(huán)狀結(jié)果,有可能導(dǎo)致GSP無法與模板退火;或SSⅡ反轉(zhuǎn)錄酶無法從此引物進(jìn)行有效延伸。

7) 目的mRNA中含有強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄中止位點(diǎn),可以試用以下方法解決:

a. 將一鏈的反應(yīng)溫度提高至50℃。

b. 使用隨機(jī)六聚體代替Oligo(dT)進(jìn)行一鏈反應(yīng)。

3. 產(chǎn)生非特異性條帶

1)用RT陰性對(duì)照檢測是否被基因組DNA污染。如果RT陰性對(duì)照的PCR結(jié)果也顯示同樣條帶,則需要用DNase I重新處理樣品。

2)在PCR反應(yīng)中,非特異的起始擴(kuò)增將導(dǎo)致產(chǎn)生非特異性結(jié)果。在低于引物Tm 2至5℃的溫度下進(jìn)行退火,降低鎂離子或是目的DNA的量將減少非特異性結(jié)果的產(chǎn)生。

3)由于mRNA剪切方式的不同,根據(jù)選擇引物的不同將導(dǎo)致產(chǎn)生不同的RT-PCR結(jié)果。

4. 產(chǎn)生彌散(smear)條帶

1)在PCR反應(yīng)體系中一鏈產(chǎn)物的含量過高

2)減少引物的用量

3)優(yōu)化PCR反應(yīng)條件/減少PCR的循環(huán)次數(shù)

4)在用DNase處理被DNA污染的RNA樣品時(shí),其產(chǎn)生的寡核苷酸片段會(huì)產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增,一般會(huì)顯示為彌散背景。

5. 產(chǎn)生大分子量的彌散條帶

1)大多數(shù)情況下是由于退火溫度過低而導(dǎo)致的非特異性的起始及延伸產(chǎn)生的

2)對(duì)于長片段的PCR,建議將反應(yīng)體系中cDNA的濃度稀釋至1:10(或1:100-1:200)

6. 在無反轉(zhuǎn)錄酶的情況下,對(duì)照RNA獲得擴(kuò)增結(jié)果詳細(xì)解析關(guān)于Elisa試劑盒的儲(chǔ)存于有效期多久



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