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:《Nature Genetics》是遺傳學領域世界*科技期刊,在6月《Nature Genetics》在線版上,兩個中國科研團隊發(fā)表了兩項重要的研究成果。
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Genome-wide association study identifies three new susceptibility loci for esophageal squamous-cell carcinoma in Chinese populations
來自中國醫(yī)學院/北京協(xié)和醫(yī)學院,南京醫(yī)科大學,北京大學等處的研究人員通過全基因組關聯(lián)研究技術發(fā)現(xiàn)了三個全新的中國人群食管鱗狀細胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma ,ESCC)易感位點,這對于解析這一疾病的分子機理,以及相關治療具有重要意義。
領導這一研究的是中國醫(yī)學*北京協(xié)和醫(yī)學院腫瘤醫(yī)院腫瘤研究所病因及癌變研究室主任林東昕教授,他曾于1998年獲得國家杰出青年科學基金,2003-2004年度被評為衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家、*頒發(fā)政府特殊津貼專家。林教授研究組曾較系統(tǒng)地研究了致癌物代謝、DNA修復、細胞周期和凋亡控制、腫瘤免疫等系統(tǒng)的基因遺傳變異與肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、結(jié)-直腸癌等常見腫瘤發(fā)生和發(fā)展的關系。
Arabidopsis REF6 is a histone H3 lysine 27 demethylase
來自中科院遺傳與發(fā)育生物學研究所的研究人員與德國的科學家一道獲得了組蛋白H3K27me3去甲基化酶研究方面的重要進展。
PcG介導的組蛋白H3第27位賴氨酸上*基化(H3K27me3)在基因沉默和發(fā)育調(diào)控中起著至關重要的作用。小鼠胚胎干細胞中超過10%的基因受該種修飾調(diào)控,擬南芥中超過7,000個基因受該修飾調(diào)控。擬南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN兩個甲基轉(zhuǎn)移酶催化,并招募LHP1結(jié)合以有效抑制基因表達。在哺乳動物中H3K27me3修飾是可逆的,但植物中并不存在哺乳動物中H3K27me3去甲基化酶KDM6的直系同源物。此前有研究表明,擬南芥中H3K27me3甲基化也是可以被主動去除的,因此揭示H3K27me3去甲基化的分子機制是植物表觀遺傳學研究中的一個重要科學問題。
在這篇文章中,研究人員對植物組蛋白去甲基化酶基因家族進行了系統(tǒng)鑒定和功能分析。該研究組首先建立了植物細胞內(nèi)組蛋白去甲基化酶活性檢測體系,通過該體系發(fā)現(xiàn)擬南芥REF6/JMJ12可以特異性地去除H3K27雙甲基化和*基化修飾。過表達REF6的植物與H3K27me3功能異常突變體具有相似的表型。
并通過遺傳學研究證明,clf swn對ref6表現(xiàn)上位效應,同時ref6可以部分回復clf的表型,表明REF6和H3K27me3甲基轉(zhuǎn)移酶起著相互拮抗的作用。通過H3K27me3抗體進行染色質(zhì)免疫共沉淀結(jié)合大規(guī)模測序分析鑒定了數(shù)百個基因H3K27me3水平上升,這些基因多數(shù)是REF6的靶基因,參與植物發(fā)育以及對各種刺激響應等多種生物學過程。轉(zhuǎn)錄組分析表明,這些基因上H3K27me3水平上升與其轉(zhuǎn)錄抑制呈正相關。
這一研究工作*了植物H3K27me3調(diào)控機制的一個重要空白,并表明該機制在高等動植物中是保守的,為進一步研究H3K27me3在植物生長發(fā)育及對環(huán)境響應過程中的作用奠定了基礎。
來源:生物通
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